在细胞内，e-box结构域主要与一系列关键的转录调控过程相关联。例如，在肌肉发育过程中，MyoD等基本螺旋-环-螺旋(bHLH)家族的转录因子会特异性地识别并结合到e-box上，从而激活或抑制目标基因的表达。此外，e-box还参与了其他多种生理活动，包括免疫反应、代谢调节以及癌症发生发展等多个方面。
值得注意的是，尽管e-box本身只是一个短小的DNA片段，但它却能够通过复杂的相互作用网络影响整个基因组的功能状态。因此，深入研究e-box及其相关蛋白的作用机制对于理解生命科学基本原理及开发新型治疗方法都具有重要意义。
